Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vgll3P85442 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vgll3P85442 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vgll3P85442 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vgll3P85442 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms