Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgfbiP82198 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgfbiP82198 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TgfbiP82198 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TgfbiP82198 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms