Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sparcl1P70663 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sparcl1P70663 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sparcl1P70663 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sparcl1P70663 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms