Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pkn1P70268 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkn1P70268 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkn1P70268 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms