Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13P70217 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd13P70217 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd13P70217 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd13P70217 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd13P70217 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms