Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsnl1P62761 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsnl1P62761 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsnl1P62761 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vsnl1P62761 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms