Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nol4P60954 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nol4P60954 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nol4P60954 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nol4P60954 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nol4P60954 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nol4P60954 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nol4P60954 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nol4P60954 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nol4P60954 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nol4P60954 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nol4P60954 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nol4P60954 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nol4P60954 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nol4P60954 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nol4P60954 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms