Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms