Protein–RNA interactions for Protein: P59268

Zdhhc9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc9P59268 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zdhhc9P59268 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zdhhc9P59268 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zdhhc9P59268 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zdhhc9P59268 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdhhc9P59268 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zdhhc9P59268 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.6 ms