Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Csrnp1P59054 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Csrnp1P59054 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Csrnp1P59054 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp1P59054 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp1P59054 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms