Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dpf3P58269 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dpf3P58269 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dpf3P58269 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dpf3P58269 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dpf3P58269 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms