Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NcstnP57716 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NcstnP57716 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcstnP57716 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcstnP57716 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NcstnP57716 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcstnP57716 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NcstnP57716 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NcstnP57716 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NcstnP57716 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NcstnP57716 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NcstnP57716 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NcstnP57716 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NcstnP57716 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NcstnP57716 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NcstnP57716 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NcstnP57716 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms