Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rp1P56716 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rp1P56716 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rp1P56716 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rp1P56716 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rp1P56716 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rp1P56716 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rp1P56716 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rp1P56716 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rp1P56716 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rp1P56716 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rp1P56716 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rp1P56716 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1P56716 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rp1P56716 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rp1P56716 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1P56716 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1P56716 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rp1P56716 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms