Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TdgP56581 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TdgP56581 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TdgP56581 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TdgP56581 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TdgP56581 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TdgP56581 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TdgP56581 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TdgP56581 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TdgP56581 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TdgP56581 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TdgP56581 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TdgP56581 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TdgP56581 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TdgP56581 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TdgP56581 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TdgP56581 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TdgP56581 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TdgP56581 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TdgP56581 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TdgP56581 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TdgP56581 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TdgP56581 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TdgP56581 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TdgP56581 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TdgP56581 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TdgP56581 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TdgP56581 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TdgP56581 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TdgP56581 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TdgP56581 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TdgP56581 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TdgP56581 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TdgP56581 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TdgP56581 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TdgP56581 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TdgP56581 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TdgP56581 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TdgP56581 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TdgP56581 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TdgP56581 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TdgP56581 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TdgP56581 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TdgP56581 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TdgP56581 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TdgP56581 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TdgP56581 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TdgP56581 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TdgP56581 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TdgP56581 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TdgP56581 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TdgP56581 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TdgP56581 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TdgP56581 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TdgP56581 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TdgP56581 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TdgP56581 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TdgP56581 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TdgP56581 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TdgP56581 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TdgP56581 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TdgP56581 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TdgP56581 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TdgP56581 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TdgP56581 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TdgP56581 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TdgP56581 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TdgP56581 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TdgP56581 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TdgP56581 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TdgP56581 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TdgP56581 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TdgP56581 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TdgP56581 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TdgP56581 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TdgP56581 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TdgP56581 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TdgP56581 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TdgP56581 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TdgP56581 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TdgP56581 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TdgP56581 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TdgP56581 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TdgP56581 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TdgP56581 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TdgP56581 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms