Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gp1bbP56400 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gp1bbP56400 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gp1bbP56400 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gp1bbP56400 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms