Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GferP56213 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GferP56213 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GferP56213 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GferP56213 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GferP56213 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GferP56213 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GferP56213 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GferP56213 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GferP56213 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GferP56213 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GferP56213 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GferP56213 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GferP56213 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GferP56213 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GferP56213 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GferP56213 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GferP56213 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GferP56213 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GferP56213 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GferP56213 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GferP56213 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GferP56213 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GferP56213 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GferP56213 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GferP56213 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GferP56213 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GferP56213 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GferP56213 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GferP56213 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GferP56213 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GferP56213 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GferP56213 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GferP56213 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GferP56213 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GferP56213 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GferP56213 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GferP56213 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GferP56213 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GferP56213 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GferP56213 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GferP56213 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GferP56213 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GferP56213 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GferP56213 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GferP56213 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GferP56213 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GferP56213 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GferP56213 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GferP56213 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GferP56213 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GferP56213 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GferP56213 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GferP56213 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GferP56213 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GferP56213 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GferP56213 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GferP56213 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GferP56213 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GferP56213 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GferP56213 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GferP56213 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GferP56213 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GferP56213 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GferP56213 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GferP56213 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GferP56213 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GferP56213 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GferP56213 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GferP56213 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GferP56213 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GferP56213 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GferP56213 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GferP56213 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GferP56213 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GferP56213 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GferP56213 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GferP56213 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GferP56213 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GferP56213 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms