Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn5P54830 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn5P54830 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn5P54830 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn5P54830 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn5P54830 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn5P54830 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms