Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms