Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtbP53612 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtbP53612 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtbP53612 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtbP53612 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtbP53612 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms