Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApodP51910 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApodP51910 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApodP51910 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApodP51910 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ApodP51910 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApodP51910 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApodP51910 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApodP51910 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApodP51910 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApodP51910 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApodP51910 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ApodP51910 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApodP51910 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApodP51910 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApodP51910 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ApodP51910 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApodP51910 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApodP51910 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApodP51910 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApodP51910 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApodP51910 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ApodP51910 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApodP51910 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ApodP51910 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ApodP51910 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApodP51910 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApodP51910 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApodP51910 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApodP51910 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApodP51910 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApodP51910 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ApodP51910 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApodP51910 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApodP51910 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApodP51910 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ApodP51910 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApodP51910 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApodP51910 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApodP51910 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApodP51910 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApodP51910 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApodP51910 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApodP51910 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ApodP51910 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApodP51910 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApodP51910 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApodP51910 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApodP51910 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApodP51910 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApodP51910 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApodP51910 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApodP51910 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ApodP51910 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApodP51910 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApodP51910 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApodP51910 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApodP51910 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms