Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf10P50592 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf10P50592 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf10P50592 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf10P50592 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms