Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GastP48757 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GastP48757 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GastP48757 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GastP48757 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GastP48757 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GastP48757 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GastP48757 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GastP48757 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GastP48757 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GastP48757 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GastP48757 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GastP48757 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GastP48757 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GastP48757 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GastP48757 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GastP48757 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GastP48757 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GastP48757 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GastP48757 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GastP48757 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GastP48757 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GastP48757 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GastP48757 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GastP48757 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GastP48757 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GastP48757 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GastP48757 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GastP48757 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GastP48757 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GastP48757 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GastP48757 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GastP48757 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GastP48757 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GastP48757 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GastP48757 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GastP48757 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GastP48757 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GastP48757 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GastP48757 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GastP48757 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GastP48757 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GastP48757 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GastP48757 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GastP48757 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GastP48757 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GastP48757 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GastP48757 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GastP48757 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GastP48757 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GastP48757 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GastP48757 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GastP48757 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GastP48757 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GastP48757 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GastP48757 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GastP48757 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GastP48757 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GastP48757 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GastP48757 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GastP48757 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GastP48757 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GastP48757 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GastP48757 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GastP48757 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GastP48757 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GastP48757 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GastP48757 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GastP48757 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GastP48757 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GastP48757 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GastP48757 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GastP48757 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GastP48757 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GastP48757 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GastP48757 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GastP48757 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GastP48757 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GastP48757 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GastP48757 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GastP48757 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GastP48757 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GastP48757 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GastP48757 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GastP48757 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GastP48757 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GastP48757 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GastP48757 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GastP48757 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GastP48757 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GastP48757 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GastP48757 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GastP48757 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GastP48757 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.5 ms