Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rfx1P48377 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx1P48377 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx1P48377 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx1P48377 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rfx1P48377 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rfx1P48377 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx1P48377 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx1P48377 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx1P48377 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx1P48377 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx1P48377 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx1P48377 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx1P48377 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx1P48377 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx1P48377 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx1P48377 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx1P48377 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx1P48377 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx1P48377 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx1P48377 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rfx1P48377 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms