Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tulp2P46686 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tulp2P46686 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tulp2P46686 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tulp2P46686 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp2P46686 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp2P46686 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms