Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sipa1P46062 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1P46062 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sipa1P46062 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sipa1P46062 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms