Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Chd1P40201 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Chd1P40201 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Chd1P40201 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Chd1P40201 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Chd1P40201 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Chd1P40201 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37,18■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Chd1P40201 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37,13■■■■□ 3,54
Chd1P40201 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
Chd1P40201 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Chd1P40201 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37,07■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Chd1P40201 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37,06■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37,04■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Chd1P40201 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Chd1P40201 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Chd1P40201 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Chd1P40201 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Chd1P40201 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Chd1P40201 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36,9■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,5
Chd1P40201 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36,88■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Chd1P40201 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Chd1P40201 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Chd1P40201 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36,84■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Chd1P40201 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Chd1P40201 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36,82■■■■□ 3,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,8 ms