Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik2P39087 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik2P39087 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik2P39087 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik2P39087 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik2P39087 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik2P39087 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik2P39087 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik2P39087 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik2P39087 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik2P39087 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik2P39087 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik2P39087 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms