Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh4P39038 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh4P39038 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh4P39038 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh4P39038 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms