Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn1P35821 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn1P35821 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn1P35821 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpn1P35821 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms