Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc5P35689 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc5P35689 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc5P35689 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc5P35689 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc5P35689 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc5P35689 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc5P35689 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms