Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TpoP35419 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TpoP35419 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TpoP35419 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TpoP35419 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TpoP35419 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TpoP35419 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TpoP35419 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TpoP35419 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TpoP35419 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TpoP35419 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TpoP35419 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TpoP35419 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TpoP35419 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TpoP35419 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TpoP35419 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TpoP35419 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TpoP35419 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TpoP35419 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TpoP35419 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TpoP35419 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpoP35419 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpoP35419 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TpoP35419 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TpoP35419 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpoP35419 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TpoP35419 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TpoP35419 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TpoP35419 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpoP35419 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpoP35419 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpoP35419 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpoP35419 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpoP35419 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpoP35419 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpoP35419 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TpoP35419 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TpoP35419 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TpoP35419 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TpoP35419 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TpoP35419 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TpoP35419 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TpoP35419 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TpoP35419 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TpoP35419 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TpoP35419 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TpoP35419 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TpoP35419 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TpoP35419 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TpoP35419 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TpoP35419 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TpoP35419 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TpoP35419 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TpoP35419 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TpoP35419 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TpoP35419 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TpoP35419 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TpoP35419 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TpoP35419 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TpoP35419 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TpoP35419 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TpoP35419 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TpoP35419 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TpoP35419 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TpoP35419 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TpoP35419 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TpoP35419 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TpoP35419 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TpoP35419 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TpoP35419 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TpoP35419 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TpoP35419 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TpoP35419 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TpoP35419 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TpoP35419 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TpoP35419 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TpoP35419 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TpoP35419 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TpoP35419 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TpoP35419 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TpoP35419 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TpoP35419 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TpoP35419 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TpoP35419 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TpoP35419 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TpoP35419 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TpoP35419 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TpoP35419 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms