Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vcam1P29533 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vcam1P29533 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcam1P29533 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vcam1P29533 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vcam1P29533 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vcam1P29533 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.4 ms