Protein–RNA interactions for Protein: P22682

Cbl, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblP22682 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CblP22682 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CblP22682 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CblP22682 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CblP22682 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CblP22682 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CblP22682 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CblP22682 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CblP22682 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CblP22682 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CblP22682 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CblP22682 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CblP22682 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CblP22682 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CblP22682 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CblP22682 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CblP22682 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CblP22682 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CblP22682 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CblP22682 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CblP22682 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CblP22682 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CblP22682 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CblP22682 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CblP22682 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CblP22682 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CblP22682 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CblP22682 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CblP22682 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CblP22682 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CblP22682 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CblP22682 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CblP22682 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CblP22682 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CblP22682 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CblP22682 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CblP22682 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CblP22682 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CblP22682 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CblP22682 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CblP22682 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CblP22682 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CblP22682 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CblP22682 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CblP22682 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CblP22682 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CblP22682 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CblP22682 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CblP22682 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CblP22682 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CblP22682 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CblP22682 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CblP22682 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CblP22682 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CblP22682 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CblP22682 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CblP22682 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CblP22682 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CblP22682 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CblP22682 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CblP22682 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CblP22682 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CblP22682 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CblP22682 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CblP22682 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CblP22682 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CblP22682 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CblP22682 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CblP22682 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CblP22682 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CblP22682 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CblP22682 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CblP22682 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CblP22682 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CblP22682 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CblP22682 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CblP22682 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CblP22682 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CblP22682 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CblP22682 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CblP22682 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CblP22682 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CblP22682 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CblP22682 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CblP22682 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CblP22682 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CblP22682 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CblP22682 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CblP22682 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CblP22682 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms