Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn1P22387 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn1P22387 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn1P22387 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn1P22387 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn1P22387 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn1P22387 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn1P22387 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn1P22387 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn1P22387 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn1P22387 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.1 ms