Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefhP19246 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefhP19246 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefhP19246 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NefhP19246 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NefhP19246 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NefhP19246 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NefhP19246 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NefhP19246 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefhP19246 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefhP19246 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefhP19246 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefhP19246 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefhP19246 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefhP19246 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefhP19246 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefhP19246 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefhP19246 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefhP19246 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefhP19246 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefhP19246 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefhP19246 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefhP19246 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefhP19246 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefhP19246 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefhP19246 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NefhP19246 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefhP19246 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefhP19246 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefhP19246 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefhP19246 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NefhP19246 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefhP19246 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefhP19246 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefhP19246 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefhP19246 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefhP19246 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefhP19246 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NefhP19246 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefhP19246 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefhP19246 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefhP19246 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefhP19246 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NefhP19246 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefhP19246 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NefhP19246 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefhP19246 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefhP19246 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefhP19246 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefhP19246 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefhP19246 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NefhP19246 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefhP19246 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NefhP19246 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefhP19246 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefhP19246 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefhP19246 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefhP19246 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefhP19246 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NefhP19246 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NefhP19246 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefhP19246 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NefhP19246 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefhP19246 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefhP19246 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NefhP19246 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NefhP19246 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NefhP19246 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefhP19246 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefhP19246 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NefhP19246 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NefhP19246 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefhP19246 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NefhP19246 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NefhP19246 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NefhP19246 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefhP19246 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefhP19246 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefhP19246 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefhP19246 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefhP19246 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 777.7 ms