Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa-rs2P17534 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs2P17534 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs2P17534 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa-rs2P17534 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms