Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd1P13516 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd1P13516 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd1P13516 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd1P13516 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd1P13516 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd1P13516 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scd1P13516 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd1P13516 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd1P13516 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd1P13516 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd1P13516 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scd1P13516 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd1P13516 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd1P13516 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scd1P13516 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scd1P13516 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms