Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tnp1P10856 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms