Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hoxc9P09633 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hoxc9P09633 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxc9P09633 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxc9P09633 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxc9P09633 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxc9P09633 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Hoxc9P09633 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Hoxc9P09633 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hoxc9P09633 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxc9P09633 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc9P09633 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms