Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb1P09055 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb1P09055 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb1P09055 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb1P09055 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb1P09055 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms