Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sod1P08228 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sod1P08228 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sod1P08228 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sod1P08228 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sod1P08228 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sod1P08228 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sod1P08228 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sod1P08228 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sod1P08228 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sod1P08228 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sod1P08228 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sod1P08228 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sod1P08228 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms