Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06328 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06328 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06328 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06328 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06328 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06328 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06328 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06328 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06328 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06328 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06328 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06328 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06328 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06328 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P06328 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P06328 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06328 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06328 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06328 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06328 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06328 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06328 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06328 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06328 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06328 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06328 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P06328 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P06328 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P06328 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P06328 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P06328 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P06328 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P06328 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P06328 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P06328 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P06328 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P06328 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P06328 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P06328 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P06328 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
P06328 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P06328 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06328 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06328 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06328 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06328 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06328 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06328 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06328 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06328 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06328 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06328 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06328 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06328 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06328 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06328 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06328 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06328 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06328 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06328 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06328 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
P06328 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06328 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06328 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06328 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06328 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06328 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06328 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06328 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06328 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06328 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06328 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06328 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06328 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06328 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06328 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06328 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06328 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06328 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06328 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms