Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrygdP04342 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CrygdP04342 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms