Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01810 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01810 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01810 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01810 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01810 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01810 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01810 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01810 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
P01810 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01810 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01810 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01810 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01810 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01810 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01810 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01810 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01810 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01810 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01810 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01810 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01810 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01810 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
P01810 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01810 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01810 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01810 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01810 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
P01810 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01810 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01810 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01810 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01810 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01810 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01810 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01810 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01810 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01810 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01810 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01810 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01810 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01810 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01810 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01810 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
P01810 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01810 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01810 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01810 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01810 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01810 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01810 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01810 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01810 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P01810 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01810 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01810 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P01810 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01810 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01810 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01810 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01810 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01810 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01810 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01810 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
P01810 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01810 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01810 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01810 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01810 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01810 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
P01810 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01810 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01810 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01810 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01810 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01810 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01810 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01810 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01810 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01810 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01810 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01810 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01810 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01810 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01810 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01810 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01810 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01810 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P01810 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01810 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01810 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01810 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms