Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01740 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01740 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01740 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01740 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01740 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01740 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01740 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01740 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01740 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01740 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
P01740 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01740 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01740 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01740 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01740 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01740 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01740 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01740 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01740 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01740 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01740 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01740 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01740 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01740 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01740 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01740 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01740 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01740 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01740 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01740 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01740 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01740 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01740 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01740 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01740 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01740 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01740 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01740 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01740 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01740 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01740 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01740 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01740 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01740 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
P01740 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01740 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01740 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01740 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01740 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01740 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01740 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01740 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01740 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01740 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01740 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01740 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01740 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01740 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01740 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01740 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01740 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01740 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01740 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01740 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01740 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01740 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01740 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01740 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01740 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01740 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01740 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01740 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01740 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01740 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01740 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01740 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P01740 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01740 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01740 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01740 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01740 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
P01740 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01740 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01740 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms