Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01672 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01672 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01672 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01672 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01672 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01672 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01672 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01672 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01672 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01672 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01672 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01672 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01672 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01672 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01672 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01672 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01672 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01672 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01672 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01672 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01672 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P01672 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01672 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01672 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01672 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01672 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01672 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01672 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01672 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01672 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
P01672 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01672 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01672 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01672 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01672 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01672 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01672 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01672 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01672 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01672 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01672 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01672 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01672 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01672 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01672 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01672 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01672 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01672 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01672 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01672 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01672 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01672 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01672 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01672 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01672 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01672 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01672 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01672 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01672 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01672 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01672 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01672 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01672 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P01672 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01672 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01672 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01672 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01672 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01672 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01672 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01672 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01672 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01672 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
P01672 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01672 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01672 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01672 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01672 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01672 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01672 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01672 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01672 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01672 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01672 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01672 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01672 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01672 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01672 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01672 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01672 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01672 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01672 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01672 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms