Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl20O89093 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl20O89093 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl20O89093 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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