Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CpdO89001 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CpdO89001 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CpdO89001 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CpdO89001 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CpdO89001 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CpdO89001 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CpdO89001 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CpdO89001 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CpdO89001 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CpdO89001 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CpdO89001 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CpdO89001 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CpdO89001 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CpdO89001 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CpdO89001 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CpdO89001 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CpdO89001 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CpdO89001 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CpdO89001 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CpdO89001 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CpdO89001 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CpdO89001 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CpdO89001 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CpdO89001 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CpdO89001 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CpdO89001 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CpdO89001 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CpdO89001 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CpdO89001 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CpdO89001 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CpdO89001 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CpdO89001 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CpdO89001 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CpdO89001 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CpdO89001 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CpdO89001 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CpdO89001 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CpdO89001 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CpdO89001 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CpdO89001 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CpdO89001 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CpdO89001 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CpdO89001 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CpdO89001 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CpdO89001 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CpdO89001 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CpdO89001 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CpdO89001 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CpdO89001 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CpdO89001 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CpdO89001 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CpdO89001 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CpdO89001 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CpdO89001 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpdO89001 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CpdO89001 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CpdO89001 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CpdO89001 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CpdO89001 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CpdO89001 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CpdO89001 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CpdO89001 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CpdO89001 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CpdO89001 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CpdO89001 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CpdO89001 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CpdO89001 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CpdO89001 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CpdO89001 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CpdO89001 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CpdO89001 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CpdO89001 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CpdO89001 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CpdO89001 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CpdO89001 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CpdO89001 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CpdO89001 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CpdO89001 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CpdO89001 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CpdO89001 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CpdO89001 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CpdO89001 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CpdO89001 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CpdO89001 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CpdO89001 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms