Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZfrO88532 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZfrO88532 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZfrO88532 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZfrO88532 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZfrO88532 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZfrO88532 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZfrO88532 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZfrO88532 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZfrO88532 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZfrO88532 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZfrO88532 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZfrO88532 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZfrO88532 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZfrO88532 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZfrO88532 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZfrO88532 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms