Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mid1O70583 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mid1O70583 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid1O70583 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mid1O70583 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid1O70583 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1O70583 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mid1O70583 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid1O70583 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid1O70583 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Mid1O70583 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mid1O70583 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mid1O70583 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1651.5 ms