Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xirp1O70373 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xirp1O70373 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Xirp1O70373 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Xirp1O70373 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Xirp1O70373 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Xirp1O70373 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xirp1O70373 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xirp1O70373 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xirp1O70373 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Xirp1O70373 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms